国际问题研究院教师长期在国内外知名学术刊物上发表学术论文和在国内外知名出版社出版学术著作，获得教育部“高等学校科学研究优秀成果奖”、“上海市哲学社会科学优秀成果奖”等多项奖励。

• 吴心伯（2010年度）、信强（2013年度）入选教育部“新世纪优秀人才支持计划” 。

• 孙德刚（2021年度）入选教育部“长江学者奖励计划”青年学者。

• 赵明昊 （2022年度）入选国家“万*人计划”青年拔尖人才。

• 2015年12月，石源华专著：《中华民国外交史新著》，获第七届高等学校科学研究优秀成果奖（人文社会科学），著作类，一等奖。

• 2020年12月，国际问题研究院教师共获2项第八届高等学校科学研究优秀成果奖（人文社会科学）。分别为：任晓：《中国对外援助：理论与实践》（与刘慧华合著），著作，二等奖；汪晓风：《网络战略：美国国家安全新支点》，著作，二等奖。
  

• 国际问题研究院教师获“上海市第十二届（2012年—2013年）哲学社会科学优秀成果奖”5项；获“上海市第十届（2012年—2013年）邓小平理论研究和宣传优秀成果奖”1项。
  

• 国际问题研究院教师获“上海市第十三届（2014年—2015年）哲学社会科学优秀成果奖”5项。
  

• 国际问题研究院教师获“上海市第十四届（2016年—2017年）哲学社会科学优秀成果奖”6项。

• 国际问题研究院教师获“上海市第十五届（2018年—2019年）哲学社会科学优秀成果奖”3项。

• 石源华专著：《中共十八大以来中国周边外交研究报告》，获中国社会科学评价研究院2018年中国智库学术成果“优秀著作奖”（2018年10月）。

• 祁怀高和薛松主编的英文著作：《南海合作开发：政策、障碍与展望》，获“2020CTTI来源智库年度优秀成果”。